Το Metal Gear Solid V: Ground Zeroes λειτουργεί ως πρόλογος του Metal Gear Solid V: The Phantom Pain και διαδραματίζεται ένα χρόνο μετά τα γεγονότα του Metal Gear Solid: Peace Walker.
Αναλαμβάνοντας τον έλεγχο του θρυλικού Snake (γνωστός και ως Big Boss), οι παίκτες χρεώνονται με τη διείσδυση στο Camp Omega όπου κρατούνται τόσο ο Paz όσο και ο Chico. Οι όμηροι έχουν βασικές πληροφορίες σχετικά με τον Snake και την ιδιωτική στρατιωτική του οργάνωση που ο Snake και ο σύμμαχός του Kaz Miller πρέπει να αποτρέψουν να εκτεθούν. Το Ground Zeroes καταγράφει τη διάσωση και τις επακόλουθες συνέπειες που οδηγεί στην αρχή του The Phantom Pain. Το Ground Zeroes λειτουργεί επίσης ως γέφυρα μεταξύ των προηγούμενων τίτλων του Metal Gear Solid, διευκολύνοντας τους παίκτες στον περίφημο ανοιχτό κόσμο του MGSV.